Wyszukiwanie:
|

|
Sortowanie:
|
|
|
Bibliografia Publikacji Pracowników PK (47397) | Inne bazy bibliograficzne (14977) Architektura i Sztuka Krakowa (2298) | Historia i Ludzie PK – baza w przygotowaniu (0) | Konferencje Krynickie - Referaty (7734) LXVI Konferencja Naukowa, 2020 (67) | LXV Konferencja Naukowa, 2019 (58) | LXIV Konferencja Naukowa, 2018 (139) | LXIII Konferencja Naukowa, 2017 (136) | LXII Konferencja Naukowa, 2016 (150) | LXI Konferencja Naukowa, 2015 (145) | LX Konferencja Naukowa, 2014 (190) | LIX Konferencja Naukowa, 2013 (110) | LVIII Konferencja Naukowa, 2012 (168) | LVII Konferencja Naukowa, 2011 (111) | LVI Konferencja Naukowa, 2010 (130) | LV Konferencja Naukowa, 2009 (108) | LIV Konferencja Naukowa, 2008 (161) | LIII Konferencja Naukowa, 2007 (161) | LII Konferencja Naukowa, 2006 (123) | LI Konferencja Naukowa, 2005 (113) | L Konferencja Naukowa, 2004 (165) | XLIX Konferencja Naukowa, 2003 (125) | XLVIII Konferencja Naukowa, 2002 (137) | XLVII Konferencja Naukowa, 2001 (154) | XLVI Konferencja Naukowa, 2000 (140) | XLV Konferencja Naukowa, 1999 (161) | XLIV Konferencja Naukowa, 1998 (140) | XLIII Konferencja Naukowa, 1997 (153) | XLII Konferencja Naukowa, 1996 (164) | XLI Konferencja Naukowa, 1995 (173) | XL Konferencja Naukowa, 1994 (151) | XXXIX Konferencja Naukowa, 1993 (148) | XXXVIII Konferencja Naukowa, 1992 (117) | XXXVII Konferencja Naukowa, 1991 (125) | XXXVI Konferencja Naukowa, 1990 (109) | XXXV Konferencja Naukowa, 1989 (150) | XXXIV Konferencja Naukowa, 1988 (177) | XXXIII Konferencja Naukowa, 1987 (195) | XXXII Konferencja Naukowa, 1986 (190) | XXXI Konferencja Naukowa, 1985 (180) | XXX Konferencja Naukowa, 1984 (143) | XXIX Konferencja Naukowa, 1983 (141) | XXVIII Konferencja Naukowa, 1982 (120) | XXVII Konferencja Naukowa, 1981 (160) | XXVI Konferencja Naukowa, 1980 (169) | XXV Konferencja Naukowa, 1979 (177) | XXIV Konferencja Naukowa, 1978 (143) | XXIII Konferencja Naukowa, 1977 (120) | XXII Konferencja Naukowa, 1976 (143) | XXI Konferencja Naukowa, 1975 (132) | XX Konferencja Naukowa, 1974 (151) | XIX Konferencja Naukowa, 1973 (131) | XVIII Konferencja Naukowa, 1972 (112) | XVII Konferencja Naukowa, 1971 (120) | XVI Konferencja Naukowa, 1970 (116) | XV Konferencja Naukowa, 1969 (75) | XIV Konferencja Naukowa, 1968 (114) | XIII Konferencja Naukowa, 1967 (100) | XII Konferencja Naukowa, 1966 (106) | XI Konferencja Naukowa, 1965 (81) |
| Niepublikowane prace naukowe pracowników PK (1994-2012) (4941) |
|
Jednostki PK
Opcje
|
Seria/Czasopismo | | International Journal of Quantum Chemistry | Numeracja | | Vol. 118, Iss. 15 | Data wydania | | 2018 | Data udostępnienia on-line | | 2018-03-01 | Język | | angielski | Typ nośnika | | online | Zakres stron | | [1-12] | Liczba stron | | 12 | Oznaczenie ilustracji | | rys., wykr. | Bibliografia (na str.) | | 10-12 | Bibliografia (liczba pozycji) | | 96 | Oznaczenie streszczenia | | Abstr. | ISSN | | 1097-461X | Charakter pracy | | publikacja naukowa | Publikacja recenzowana | | tak | Rodzaj publikacji | | oryginalny artykuł naukowy (original article) | DOI | | 10.1002/qua.25617 | Opis bibliograficzny | | ONIOM and FMO-EDA study of metabotropic glutamate receptor 1: Quantum insights into the allosteric binding site / Paweł Śliwa, Rafał Kurczab, Andrzej J. Bojarski // International Journal of Quantum ... więcejONIOM and FMO-EDA study of metabotropic glutamate receptor 1: Quantum insights into the allosteric binding site / Paweł Śliwa, Rafał Kurczab, Andrzej J. Bojarski // International Journal of Quantum Chemistry [Dokument elektroniczny]. – 2018, Vol. 118, Iss. 15, 12 s. : rys., wykr. – Tryb dostępu: http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/qua.25617/epdf. – Bibliogr. 96 poz., Abstr. – Data udostępnienia online: 2018-03-01. – doi: 10.1002/qua.25617. – ISSN 1097-461X |
Słowa kluczowe | | fragment molecular orbital, G protein-coupled receptor, mGluR1, ONIOM | Abstrakt | | The crystal structure of metabotropic glutamate receptor 1 (mGluR1) complexed with 4-fluoro-N-(4-(6-(isopropylamino)pyrimidin-4-yl)thiazol-2-yl)-N-methylbenzamide (FITM, a negative allostericmodulator) ... więcejThe crystal structure of metabotropic glutamate receptor 1 (mGluR1) complexed with 4-fluoro-N-(4-(6-(isopropylamino)pyrimidin-4-yl)thiazol-2-yl)-N-methylbenzamide (FITM, a negative allostericmodulator) and its twelve close structural analogs with a broad spectrum of affinities (2.4nM < IC50> 10 000 nM) were investigated using quantum mechanical methods. The our own N-layered integrated molecular orbital and molecular mechanics (ONIOM) was used to optimize themolecular geometries of the receptor with complexed ligands, which were then used to performthe ab initio calculations using the fragment molecular orbitals method with energy decompositionanalysis (FMO-EDA). The results clearly showed that residues Q6603.28and/or Y8056.55were theanchoring points for all the studied analogs of FITM, while the H-bond with T8157.38determinedonly the orientation of very active molecules containing an amino substituent in the pyrimidinemoiety (e.g., FITM). The orientation of the other parts of ligands resulted from hydrophobic inter-actions mainly with L7575.44,F8016.51,orW7986.48.TheappliedONIOM/FMO–EDA approachfacilitated the study of effects related to very small changes in the ligand structure and led to con-clusions regarding the significance of individual interactions in the allosteric binding pocket ofmGluR1. |
Lista MNiSW/MEiN | | A | Punktacja czasopisma | | 20 | Impact Factor | | 2.263 | Publikacja indeksowana w Web of Science | | tak | Publikacja indeksowana w bazie Scopus | | tak | Dyscyplina | | inżynieria chemiczna |
Publikacja w Open Access (OA) | | nie |
Link do publikacji | | przejdź | Kolekcja | | |
|